Chấn thương xảy ra trong trận U22 Việt Nam gặp U22 Hàn Quốc ngày 15/11 tại Panda Cup 2025, khi Văn Trường va chạm mạnh ở khu vực giữa sân và phải rời sân bằng cáng. Sau khi về nước, kiểm tra chuyên sâu xác nhận đứt dây chằng chéo trước, buộc phải phẫu thuật thay vì chỉ phục hồi bảo tồn như chẩn đoán ban đầu. Ca mổ diễn ra thuận lợi, và theo đề nghị của câu lạc bộ Hà Nội, anh sẽ được theo dõi tại cơ sở y tế do câu lạc bộ chọn.
Việc Văn Trường nghỉ thi đấu dài hạn, dự kiến hết mùa giải 2025-2026, là tổn thất lớn cho U22 Việt Nam trong chuẩn bị SEA Games 33 và Vòng chung kết U23 châu Á 2026. Tiền vệ sinh năm 2003 là trụ cột tuyến giữa, nổi bật tại U23 Đông Nam Á, Vòng loại U23 châu Á, và là hạt nhân trong lối chơi dưới thời huấn luyện viên Kim Sang-sik .
Lãnh đạo VFF đã gửi lời động viên, chúc Văn Trường sớm hồi phục để trở lại mạnh mẽ hơn cho câu lạc bộ và đội tuyển quốc gia. Huấn luyện viên Kim Sang-sik đang lên phương án thay thế từ các tài năng như Thành Trung, Đức Việt hoặc Lê Phát nhằm duy trì mục tiêu huy chương vàng SEA Games 33.
