Tại bảng A, câu lạc bộ Huế gây thất vọng khi để thua 0-1 trước Hà Nội, qua đó làm thay đổi cục diện nhóm đầu. Trong khi đó, câu lạc bộ Công An Hà Nội có chiến thắng quan trọng 2-1 trước Trung tâm Bóng đá Đào Hà, vươn lên bằng điểm với Huế khi cùng có 4 điểm. Tuy nhiên, Thể Công Viettel vẫn giữ ngôi đầu bảng với 6 điểm tuyệt đối sau 2 trận.
Bảng B chứng kiến những trận thắng đậm. Đông Á Thanh Hóa lần đầu tiên giành chiến thắng với tỷ số 7-0 trước Hải Phòng. Sông Lam Nghệ An duy trì phong độ ấn tượng khi đánh bại Thép Xanh Nam Định 5-0, nâng tổng số bàn thắng lên 13 sau 3 lượt trận. Đương kim đầu bảng PVF-CAND tiếp tục khẳng định sức mạnh khi thắng Luxury Hạ Long 7-0, giữ vững ngôi đầu với 9 điểm và chưa để thủng lưới bàn nào.
Tại bảng C, Gia Lai và SHB Đà Nẵng hòa nhau 1-1, khiến cả 2 vẫn chưa có chiến thắng đầu tay. Trong khi đó, TP.HCM tiếp tục thăng hoa khi đánh bại Quảng Ngãi 2-0, vươn lên dẫn đầu bảng với 6 điểm sau 2 trận toàn thắng, hơn đội xếp thứ hai LPBank HAGL 2 điểm.
Ở bảng D, Vĩnh Long có được chiến thắng đầu tiên khi vượt qua Đồng Nai 1-0. Tây Ninh và An Giang chia điểm sau trận hòa 1-1, trong khi trận đấu giữa Becamex Bình Dương và câu lạc bộ TP.HCM khép lại mà không có bàn thắng nào được ghi. TP.HCM vẫn dẫn đầu bảng với 7 điểm, nhưng đang chịu sức ép từ An Giang (5 điểm) và Vĩnh Long (4 điểm).
Lượt trận thứ ba đã phần nào bộc lộ sự cân bằng và hấp dẫn của vòng loại U17 quốc gia 2025. Những diễn biến này hứa hẹn mang tới những cuộc tranh tài quyết liệt, hấp dẫn trong các vòng đấu kế tiếp.
