Mendy được Man City chiêu mộ với giá 50 triệu bảng vào năm 2017 từ Monaco với bản hợp đồng có thời hạn 6 năm. Tuy nhiên, Mendy bị vướng vào cáo buộc cưỡng hiếp một phụ nữ 24 tuổi trong phòng ngủ tại nhà riêng ở Cheshire (Anh) vào tháng 10/2020. Ngoài ra, anh còn bị buộc tội cố gắng cưỡng hiếp một phụ nữ khác tại nhà riêng 2 năm trước đó.
Mendy đã hầu tòa 2 lần nhưng được tuyên trắng án vào năm ngoái. Chỉ 1 tháng sau khi dính cáo buộc, Mendy bị Man City cắt mọi khoản thanh toán trong hợp đồng. Giám đốc Điều hành Etihad khi đó, ông Omar Berrada đã đảm bảo với Mendy rằng hậu vệ người Pháp sẽ nhận được tiền lương chưa trả sau khi tòa xóa tội.
Tuy nhiên, sau khi được xử vô tội, Mendy đã nhắn cho Omar Berrada vào tháng 11/2022 nhưng không nhận được phản hồi. Theo hợp đồng với Man City, Mendy nhận lương 500 nghìn bảng/tháng, thưởng 900 nghìn bảng nếu xuất hiện trong 60% số trận của đội. Ngoài ra, Mendy còn được thưởng 1 triệu bảng nếu Man City đủ điều kiện dự Champions League và 1,2 triệu bảng tiền bản quyền truyền hình hằng năm.
Benjamin Mendy đã đưa Man City ra tòa sau khi nhà đương kim vô địch Premier League từ chối thanh toán tiền lương, thưởng và bản quyền hình ảnh kể từ khi cầu thủ người Pháp dính cáo buộc hiếp dâm vào năm 2021. Mendy và đội ngũ luật sư cáo buộc Man City "tự động khấu trừ trái phép" 11,5 triệu bảng tiền lương (trước thuế) của anh trong 22 tháng hậu vệ này bị tạm giam để phục vụ công tác điều tra.
Sau thời gian dài điều tra, Tòa án Lao động Anh ngày 6/11 phán quyết Mendy thắng kiện Man City. Tuy nhiên, phán quyết của tòa án không cho Mendy hưởng toàn bộ số tiền 11,5 triệu bảng kể trên. Dẫu vậy, "ngôi sao" người Pháp vẫn sẽ nhận được phần lớn số tiền mình yêu cầu. Số tiền chính xác sẽ được các bên liên quan thỏa thuận riêng. Nếu Man City và Mendy không dàn xếp được với nhau, tòa sẽ quyết định trong một phiên điều trần khác.
Về phần mình, sau khi hết hạn hợp đồng với The Citizens vào mùa hè 2023, Mendy đã trở về quê nhà thi đấu cho câu lạc bộ hạng 2 Pháp - Lorient.
