Liên đoàn Bóng bàn thành phố Cần Thơ tổ chức Đại hội nhiệm kỳ đầu tiên vào năm 2013, đánh dấu giai đoạn chuyển đổi từ Hội sang Liên đoàn, một bước phát triển của bóng bàn tại Cần Thơ. Trong nhiệm kỳ 2013-2017, Liên đoàn đã phối hợp cùng các câu lạc bộ trong thành phố và các tỉnh An Giang, Đồng Tháp tổ chức gần 40 giải đấu dành cho các nhóm phong trào và nâng cao, giới thiệu và cử hơn 500 lượt vận động viên tham gia gần 50 giải, thi đấu giao hữu trong và ngoài Đồng bằng sông Cửu Long.

Toàn thành phố hiện có gần 300 người thường xuyên tham gia tập luyện tại các sân bóng bàn của 9/9 quận, huyện và các câu lạc bộ. Liên đoàn cũng hỗ trợ các địa phương tổ chức Đại hội Thể dục thể thao các cấp, thành lập các câu lạc bộ…
Trong nhiệm kỳ 2022-2027, Liên đoàn tiếp tục đề ra các nhiệm vụ: huy động và phát triển hội viên đạt 300 người; có 15 câu lạc bộ trực thuộc; tổ chức các lớp bồi dưỡng ngắn hạn về công tác huấn luyện, trọng tài cho khoảng 100 người; tổ chức giải truyền thống hàng năm; cử vận động viên tham gia thi đấu giải; tạo nguồn kinh phí để duy trì hoạt động…