Ở bảng B, U17 Sông Lam Nghệ An chỉ cần một kết quả hòa để giành vé vào tứ kết, còn U17 LPBank Hoàng Anh Gia Lai buộc phải thắng mới có hy vọng. Đội bóng xứ Nghệ sớm có lợi thế khi phút 12, Viết Duy solo từ giữa sân rồi lốp bóng chuẩn xác mở tỷ số. Dù đội trưởng Vũ Thái của Hoàng Anh Gia lai gỡ hòa 1-1 bằng cú sút phạt đẹp mắt ở phút 40, nhưng sang hiệp 2, Sông Lam Nghệ An bùng nổ trở lại. Anh Đức tung cú sút xa nâng tỷ số 2-1 ở phút 69, trước khi Huy Phan bật cao đánh đầu ấn định chiến thắng 3-1, qua đó đưa Sông Lam Nghệ An tiến vào vòng tứ kết với ngôi nhì bảng.
Ở trận đấu cùng giờ, U17 Hà Nội thể hiện bản lĩnh trước Becamex TP.HCM khi giành chiến thắng 2-0. Tiền đạo Mạnh Quân trở thành người hùng với cú đúp, giúp Hà Nội tiến bước đầy thuyết phục. Với kết quả này, cả Hà Nội và Sông Lam Nghệ An cùng có 7 điểm, chia nhau 2 vị trí dẫn đầu bảng B. Becamex TP.HCM kết thúc vòng bảng với 3 điểm, trong khi LPBank Hoàng Anh Gia Lai trắng tay sau 3 trận và chính thức bị loại.
Ở bảng C, U17 Thể Công Viettel có màn trình diễn bùng nổ khi đè bẹp U17 TP.HCM với tỷ số 7-2. Ngay trong hiệp 1, đội bóng áo lính đã ghi tới 5 bàn, trong đó Đại Nhân lập cú đúp, Đức Tài, Đình Vỹ và Huy Hoàng lần lượt tỏa sáng. TP.HCM rút ngắn cách biệt bằng bàn thắng của Phú Cường, nhưng sang hiệp 2, Thể Công tiếp tục áp đảo. Anh Quân và Huy Hoàng ghi thêm 2 bàn để ấn định chiến thắng đậm đà, bất chấp nỗ lực muộn màng giúp Lê Nhân gỡ một bàn cho TP.HCM.
Trận đấu còn lại chứng kiến sức mạnh vượt trội của PVF-CAND. Sau hiệp 1 có phần chủ quan khiến An Giang gỡ hòa 1-1 nhờ cú sút xa đẹp mắt của Trung Ngô, thầy trò huấn luyện viên Nguyễn Ngọc Duy đã vùng lên mạnh mẽ sau giờ nghỉ. Cầu thủ vào sân thay người Văn Dương trở thành tâm điểm với một cú hat-trick, xen kẽ là các bàn thắng của Trung Anh và Nam Hiếu, giúp PVF-CAND giành chiến thắng 5-1. Đây cũng là trận toàn thắng thứ ba liên tiếp của đội bóng này, khẳng định vị thế ứng cử viên sáng giá cho ngôi vô địch.
Khép lại vòng bảng, Hà Nội và Sông Lam Nghệ An (cùng 7 điểm) giành vé đi tiếp ở bảng B. Tại bảng C, PVF-CAND (9 điểm, toàn thắng) và Thể Công (6 điểm) đoạt 2 tấm vé tứ kết. Becamex TP.HCM và An Giang (cùng có 3 điểm) sẽ phải chờ so sánh thành tích với các đội xếp thứ ba khác để nuôi hy vọng đi tiếp, trong khi LPBank Hoàng Anh Gia Lai và TP.HCM chính thức bị loại.
Ngày 19/9, bảng A sẽ bước vào lượt trận cuối, hứa hẹn những cuộc cạnh tranh quyết liệt để xác định nốt các đội góp mặt ở vòng tứ kết Vòng chung kết U17 Quốc gia - Cúp Thái Sơn Nam 2025.
