Lý do được huấn luyện viên Troussier đưa ra là cầu thủ đang khoác áo câu lạc bộ Yokohama ở J.League 2 bị tái phát chấn thương ở cổ chân nên cần thêm thời gian để hồi phục hẳn. Công Phượng gặp chấn thương trong buổi tập ở câu lạc bộ từ hồi tháng 2 và hiện tại vẫn chưa khỏi hẳn. Dù trở về Việt Nam từ rất sớm, nhưng Công Phượng chỉ được tập cùng các cầu thủ U23 Việt Nam và chưa có buổi tập nào cùng đội tuyển. Sau khi trợ lý Moulay Lahsen được phân công cùng đội tuyển U23 sang Tajikistan thi đấu 2 trận giao hữu, Công Phượng quay trở về đội tuyển và được các bác sỹ kiểm tra và phát hiện, chấn thương ở cổ chân vẫn chưa khỏi hẳn và có thể tái phát nghiêm trọng hơn nếu tiếp tục tập luyện, thi đấu với cường độ cao.
Sau thời gian dài không ra sân thi đấu cả ở câu lạc bộ và đội tuyển Việt Nam, mặc dù Công Phượng rất khát khao trong bối cảnh huấn luyện viên Troussier cũng đang tìm kiếm tiền đạo có đẳng cấp, kinh nghiệm để thay thế Phạm Tuấn Hải, bất ngờ bị chấn thương ngay trước ngày hội quân. Ông thầy người Pháp thậm chí đã thân chinh sang tận Nhật Bản để gặp gỡ, tìm hiểu và xem Công Phượng thi đấu trong đội hình 2 của câu lạc bộ Yokohama và đi đến quyết định, gọi chân sút người Nghệ An quay trở lại đội tuyển sau thời gian dài tưởng như đã bị lãng quên.
Vậy mà thật đáng tiếc cho Công Phượng, ngay trong thời điểm đội tuyển Việt Nam rất cần và chính bản thân cũng khao khát tìm kiếm cơ hội để khẳng định giá trị và đẳng cấp thì chấn thương lại tái phát. Trước buổi tập cuối cùng tại Hà Nội hôm 18/3, chân sút từng được ví như “gà son” của đội tuyển Việt Nam thậm chí đã năn nỉ huấn luyện viên Troussier cho vào sân tập cùng đồng đội và nhà cầm quân người Pháp cũng đã có chút xiêu lòng khi đồng ý để các bác sỹ thăm khám và xem xét kỹ lưỡng hơn chấn thương cổ chân của cậu học trò đang khát khao thi đấu. Kết quả hội chuẩn là Công Phượng phải cần tới phép màu mới có thể hồi phục để vào sân thi đấu, nhưng cũng chỉ giới hạn vài chục phút.
Tất nhiên, huấn luyện viên Troussier không muốn mạo hiểm dù rất thông cảm với cậu học trò đang khát khao đến mức, chấp nhận mọi rủi ro, thậm chí sẵn sàng đánh đổi, nhưng vẫn bị loại khỏi danh sách đăng ký cho 2 trận đấu với Indonesia tại Vòng loại World Cup 2026 khu vực châu Á.
Trong số 5 cầu thủ không cùng đội tuyển Việt Nam sang Indonesia, đáng tiếc và khiến nhiều người phải suy nghĩ nhất có lẽ là Công Phượng. Ngoài Duy Mạnh thì đã chủ động xin huấn luyện viên Troussier được rút lui để điều trị dứt điểm chấn thương cơ đùi, Trương Tiến Anh, Hai Long và Giáp Tuấn Dương còn trẻ. Nhưng Công Phượng đã sắp bước qua tuổi 30 và cơ hội, có lẽ cũng chẳng còn nhiều nữa.
