Ông Phan Thanh Hùng sinh ra tại xứ Quảng và sớm trở thành một trong những biểu tượng lớn của bóng đá miền Trung. Khi còn thi đấu chuyên nghiệp, ông khoác áo câu lạc bộ bóng đá Quảng Nam Đà Nẵng (tiền thân của câu lạc bộ SHB Đà Nẵng ngày nay) suốt giai đoạn từ năm 1980 đến 1992. Cột mốc chói lọi nhất trong sự nghiệp cầu thủ của ông là cùng đội bóng quê hương bước lên ngôi vô địch toàn quốc (tiền thân của V.League) vào năm 1992.
Đến năm 1993, cựu danh thủ Phan Thanh Hùng vinh dự khoác áo đội tuyển quốc gia Việt Nam. Dù vậy, ở thời điểm bóng đá nước nhà mới bắt đầu hành trình tái hòa nhập với sân chơi quốc tế và lực lượng mặt bằng chung còn hạn chế, ông chưa thể có được những thành tích thực sự nổi bật trong màu áo cờ đỏ sao vàng khi còn là cầu thủ.
Khác với sự nghiệp cầu thủ, nghiệp cầm quân mới là nơi tài năng chuyên môn cùng tư duy bóng đá hiện đại của huấn luyện viên Phan Thanh Hùng tỏa sáng rực rỡ nhất. Năm 2007, ông bắt đầu sự nghiệp "cầm quân" chuyên nghiệp khi dẫn dắt câu lạc bộ SHB Đà Nẵng (2007-2009). Đến năm 2010, ông quyết định ra Bắc để đảm nhận chiếc ghế "thuyền trưởng" câu lạc bộ Hà Nội T&T (nay là Hà Nội FC).
Đây chính là giai đoạn hoàng kim rực rỡ nhất trong sự nghiệp huấn luyện của nhà cầm quân xứ Quảng. Với triết lý kiểm soát bóng ngắn mượt mà cùng khả năng nâng tầm cầu thủ trẻ, huấn luyện viên Phan Thanh Hùng đã đưa đội bóng của bầu Hiển đăng quang V.League vào các năm 2010 và 2013, bên cạnh danh hiệu Siêu Cúp Quốc gia 2010. Thành công này đã đặt nền móng vững chắc, mở ra kỷ nguyên thống trị đưa Hà Nội FC trở thành đội bóng giàu thành tích nhất Việt Nam sau này.
Rời Hà Nội FC năm 2016, ông chuyển sang dẫn dắt Than Quảng Ninh và ngay lập tức giúp đội bóng vùng mỏ đoạt Cúp Quốc gia 2016. Sau đó, vị chiến lược gia này tiếp tục cống hiến chuyên môn cho Becamex TP.HCM (2020-2021) cùng hai giai đoạn dẫn dắt SHB Đà Nẵng (2021-2023 và 2025).
Ở cấp độ các đội tuyển quốc gia, ông Phan Thanh Hùng từng giữ vai trò tạm quyền thay huấn luyện viên Henrique Calisto "chèo lái" U23 Việt Nam tại ASIAD 2010, trước khi chính thức nắm quyền huấn luyện viên trưởng đội tuyển quốc gia Việt Nam tham dự ASEAN Cup 2012.
Năm ngoái, huấn luyện viên Phan Thanh Hùng bất ngờ thông báo chia tay câu lạc bộ SHB Đà Nẵng và rút về "ở ẩn" tại nhà riêng tại TP. Đà Nẵng. Trong những tháng gần đây, sức khỏe của nhà cầm quân giàu tâm huyết này bắt đầu có dấu hiệu suy giảm nhanh chóng.
Đáng chú ý, hôm 9/8 vừa qua, Liên đoàn Bóng đá Việt Nam (VFF) đã tổ chức buổi gặp mặt trang trọng tại nhà riêng để trao tặng Kỷ niệm chương “Vì sự nghiệp bóng đá Việt Nam” cho huấn luyện viên Phan Thanh Hùng, nhằm ghi nhận và tôn vinh những cống hiến trọn đời của ông cho sự phát triển của bóng đá nước nhà.
Sự ra đi đột ngột vào đêm 11/8 của huấn luyện viên Phan Thanh Hùng ở tuổi 66 đã để lại niềm thương tiếc vô hạn cho gia đình, đồng nghiệp, các thế hệ học trò cùng đông đảo người hâm mộ bóng đá Việt Nam. Một nhà cầm quân tài ba, mẫu mực và tận tụy đã khép lại hành trình bóng đá của mình, nhưng những di sản ông để lại sẽ còn mãi với bóng đá Việt Nam.