Những năm gần đây, Ban Quản lý Vườn quốc gia Côn Đảo đã thực hiện nhiều kế hoạch để bảo vệ môi trường tại Côn Đảo như: Vườn quốc gia Côn Đảo không còn sản phẩm nhựa dùng một lần; Kế hoạch tổ chức thu gom, xử lý rác tại một số đảo nhỏ thuộc Vườn quốc gia Côn Đảo; Hưởng ứng Ngày Môi trường thế giới (5/6), Tuần lễ Biển và Hải đảo Việt Nam (1-8/6) và Ngày Đại dương thế giới (8/6) năm 2020.