Mùa giải năm nay tiếp tục chứng kiến sự góp mặt của 9 đội bóng từ mùa 2025, gồm: Đắk Lắk, Hoài Đức, Lâm Đồng, Quảng Ngãi (đội Kon Tum trước đây), PVF, Tây Ninh, Trẻ Hà Nội, Trẻ SHB Đà Nẵng và Vĩnh Long. Bên cạnh đó, Huế - đội bóng vừa xuống hạng từ Giải hạng Nhất Quốc gia 2024-2025 - sẽ góp mặt cùng 4 tân binh giành quyền thăng hạng từ Giải hạng Ba Quốc gia 2025 là: Trẻ Phù Đổng, Trẻ Công an Hà Nội, Trung tâm Huấn luyện và Thi đấu Thể dục thể thao Hà Tĩnh, Trường Giang Gia Định.
Ở giai đoạn vòng loại, các đội được chia bảng và thi đấu theo thể thức vòng tròn 2 lượt (lượt đi - lượt về, sân nhà - sân khách) để tính điểm và xếp hạng. Hai đội có thứ hạng cao nhất ở mỗi bảng sẽ giành quyền vào Vòng chung kết, trong khi 2 đội có số điểm và chỉ số phụ thấp nhất sẽ phải xuống thi đấu ở hạng thấp hơn mùa sau. Trường hợp có đội rút lui hoặc bị loại khỏi giải, toàn bộ kết quả thi đấu của đội đó sẽ bị hủy và VFF sẽ xem xét, điều chỉnh số lượng đội xuống hạng cho phù hợp với tình hình thực tế.
Vòng chung kết sẽ có 4 đội xuất sắc vượt qua vòng loại, thi đấu theo sơ đồ bắt cặp loại trực tiếp. Hai trận bán kết được ký hiệu là T1 (nhất bảng A gặp nhì bảng B) và T2 (nhất bảng B gặp nhì bảng A). Hai đội thắng ở T1 và T2 sẽ giành quyền thăng hạng trực tiếp lên Giải hạng Nhất Quốc gia 2026-2027, còn 2 đội thua sẽ gặp nhau ở trận T3 để xác định suất thăng hạng thứ ba.
Theo kế hoạch, vòng loại lượt đi sẽ diễn ra từ ngày 24/3 đến 25/4/2026, lượt về từ ngày 6/5 đến 7/6/2026 và Vòng chung kết tổ chức từ ngày 13 đến 16/6/2026. Các trận đấu sẽ bắt đầu lúc 15 giờ trên các sân không có hệ thống chiếu sáng và lúc 16 giờ đối với những sân đủ điều kiện về ánh sáng nhân tạo.
Giải hạng Nhì Quốc gia 2026 hứa hẹn sẽ mang đến những cuộc cạnh tranh quyết liệt và hấp dẫn, là bàn đạp quan trọng để các đội bóng trẻ và giàu khát vọng khẳng định mình trên hành trình hướng tới Giải hạng Nhất Quốc gia mùa bóng tới.