Lễ bốc thăm dự kiến diễn ra vào lúc 14 giờ 30 tại trụ sở Liên đoàn Bóng đá Việt Nam (VFF). Đến thời điểm hiện tại, sau 2 lần trì hoãn để chờ các đội bóng hoàn tất thủ tục đăng ký tham dự, giải hạng Nhất Quốc gia 2024-2025 đã có sự góp mặt của 11 câu lạc bộ, gồm: Khánh Hòa, PVF, Bình Phước, Huế, Bà Rịa - Vũng Tàu, Ninh Bình, Long An, Hòa Bình, Đồng Tháp, Đồng Nai và Thanh Niên thành phố Hồ Chí Minh.
Đội bóng duy nhất rút lui, không tham dự là Định Hướng Phú Nhuận. Trước giờ bốc thăm, có tin câu lạc bộ Thanh niên thành phố Hồ Chí Minh đổi tên từ đội Trẻ thành phố Hồ Chí Minh dự định sẽ ra thi đấu tại Ninh Bình, trong khi chủ nhà Ninh Bình xếp hạng 5 mùa bóng trước sẽ vào Nam và đổi tên thành Thủ Đức FC để tham dự giải. Trước đó, đội Long An sau khi được chuyển giao về Sở Văn Hóa, Thể Thao và Du lịch chỉ còn tên gọi cùng 7 cầu thủ và huấn luyện viên Phan Văn Giàu sẽ lên hội quân tại Pleiku để kết hợp với đội trẻ U21 Hoàng Anh Gia Lai do huấn luyện viên Trịnh Duy Quang dẫn dắt tham dự giải hạng Nhất Quốc gia 2024-2025.
Sân chơi hạng Nhất đang chứng kiến nhiều biến động, thậm chí có những dấu hiệu bất thường sau hậu trường với sự dịch chuyển, thay đổi tên gọi, thậm chí "thay máu" cầu thủ theo kiểu “hồn trương ba, da hàng thịt” để lách luật và phục vụ toan tính của các ông chủ chi tiền cho các đội bóng.
Do chỉ có 11 đội tham dự như mùa giải năm ngoái nên sẽ có 1 đội bóng phải nghỉ thi đấu và mỗi vòng sẽ diễn ra 5 cặp đấu. Các đội vẫn đá theo thể thức lượt đi - lượt về trên sân nhà và sân khách để tính điểm xếp hạng. Đội vô địch sẽ có vé thăng hạng, trong khi á quân hạng Nhất sẽ thi đấu play-off với đội áp chót V.League để tranh vé vớt. Giải hạng Nhất Quốc gia 2024-2025 dự định khởi tranh từ ngày 26/10 tới, sẽ chỉ có 1 suất xuống chơi ở giải hạng Nhì dành cho đội bóng xếp cuối bảng.
Cũng trong chiều 12/9, các đội bóng tham dự Cúp Quốc gia 2024-2025 sẽ tiến hành bốc thăm, phân cặp ở vòng loại. 14 câu lạc bộ đang thi đấu tại V.League và 11 đội hạng Nhất sẽ tranh Cúp theo thể thức loại trực tiếp. Vòng loại sẽ có 9 cặp đấu để tranh vé vào vòng 1/8 cùng 7 đội bóng được đặc cách không tham dự vòng đấu loại. Cúp Quốc gia 2024-2025 khởi tranh vào ngày 19/10.
